No âmbito das suas atividades de investigação, o DCSA tem duas Unidades de Investigação, ambas financiadas pela FCT/MEC:
- Centro Interuniversitário de História das Ciências e da Tecnologia - CIUHCT
- Unidade de Investigação, Educação e Desenvolvimento - UIED
- O Centro de Estudos Avançados em Gestão e Economia - CEFAGE